Первичная профсоюзная организация работников Сибирского федерального университета является структурным подразделением Профсоюза работников народного образования и науки РФ и Красноярской краевой организации Профсоюза.
Первичная профсоюзная организация работников Сибирского федерального университета в своей деятельности руководствуется Конституцией РФ, законами и иными нормативно-правовыми актами РФ, Красноярского края, Уставом Профсоюза, нормативными актами Профсоюза и соответствующей территориальной организацией профсоюза.
Первичная профсоюзная организация работников Сибирского федерального университета создана для реализации уставных целей и задач Профсоюза по представительству и защите социально-трудовых, профессиональных прав и интересов работников университета.
28 марта 2007 года на учредительной профсоюзной конференции работников СФУ было принято решение о создании первичной профсоюзной организации (ППОР) СФУ Профсоюза работников народного образования и науки РФ.
25 октября 2019 года на IV отчётно-выборной конференции Первичной профсоюзной организации работников СФУ председателем профкома был единогласно избран Сергей Сагалаков.